22 Things Amiss in Medicine Today

January 25th, 2015

A column from Sep 6, 2011 by Dr. George Lundberg and Dr. Clifton Meador about a set of 22 false assumptions, practice failures, and everyday clinical errors that they believe are common in modern medical practice:

  1. Lack of appreciation of the phenomenon of physician persuasion and its hidden power. The placebo effect is scientific, potent, and worthy of use.
  2. Lack of understanding of the power of prevalence or pretest probability in the diagnostic process, leading to frequent false positives and “overdiagnosis” of nonexistent diseases.
  3. Lack of understanding that many disease processes are gradual and progressive — not "on or off" signals; analog and not digital. This leads to great confusion about when to diagnose and treat. For example, at what percent stenosis is an artery "diseased" and in need of treatment?
  4. Incorrect assignment of reductions in death rates and increasing life expectancy to curative medicine rather than to preventive efforts.
  5. Medicine has a tendency to remove many physicians from relying on direct experience and personal observations and replace this with a reliance on indirect information. This leads to an over-reliance on lab and imaging findings by both patients and doctors.
  6. Lack of long-term clinical outcome data, stratified by gender and age, leading to an inability to obtain a truly informed consent.
  7. The mind-body dichotomy, present since René Descartes in the 1600s, holds erroneously that the mind and body are completely separated. This false separation leads us to believe that the lack of evidence for disease in the body of a symptomatic patient confers a diagnosis of mental disease: Thus the non-helpful statement to the patient, "Don’t worry, it’s all in your head."
  8. Lack of appreciation for what is scientifically established versus what is still in the thought stage of development.
  9. A failure of medicine to recognize what it can effectively treat and what it cannot, and admitting that some diseases have no effective treatment.
  10. Failure to recognize that the fields of human biology and clinical medicine overlap but do not coexist. Schools of medicine are becoming more schools of human biology and less schools of clinical medicine.
  11. Absence of a test that will distinguish well from sick. The lack of a test leads to the erroneous assumption of sickness as the rule of thumb for almost all patients.
  12. Lack of a blood or urine test that can measure mental status. Dementia can be missed in up to 20% of admissions to hospitals.
  13. Lack of full understanding of the intense secondary gain of illness.
  14. Fallacy of the first lesion found being assigned importance, whether or not it is the cause of the symptoms.
  15. Fallacy of any lesion found being sufficient to explain symptoms.
  16. Failure to stop a drug or treatment when it is not helping.
  17. Failure to identify what abnormality or test result is to be followed to determine success or not, when someone is being treated.
  18. Failure to look for little signs of improvement and stick with the treatment rather than change it too soon.
  19. Failure to know a patient well enough to know what their wishes are in terminal or hopeless situations.
  20. Failure to recognize and advise the family when a condition or situation is futile and should move to palliation and comfort care.
  21. Failure to keep the number of drugs to a minimum.
  22. And, number 22, perhaps the most important to today’s society:

  23. An exaggerated and unfounded fear of malpractice suits with abdication of professional responsibility just to avoid any chance of being sued.

Many of the false assumptions listed here can be found in Clifton Meador’s book "A Little Book of Doctors’ Rules" published in 1992 by Hanley & Belfus, out of print, but still available at Amazon.

Logique et Calcul par Jean-Paul Delahaye

January 18th, 2015

Les articles de la rubrique "Logique et calcul" de Jean-Paul Delahaye publiés dans le journal Pour la science sont disponibles pour la période 1991-2013 : http://www.lifl.fr/~delahaye/pls/

Où est Charlie

January 14th, 2015

Tine  explique que Charlie Hebdo, épuisé dans tous les points de vente en France, va finalement tirer à 5 millions d’exemplaires.

Mais encore faut-il se souvenir comment fonctionne ce truc !

Lendemain… de quoi ?

January 12th, 2015

Il y a le succès des marches Charlie. Un peuple angoissé qui se regroupe après avoir été attaqué par trois mujahidin et superbement immortalisé par le photographe Martin Argyroglo

Et puis il y a ces gens, enfermés dans la cage aux fauves, comme cette enfant yézidie de 6 ans dont la blondeur et les yeux bleux sont comme une insulte pour les fanatiques.

Youssef Boudlal, photographe pour Reuters décrit sa rencontre à Fishkhabour, sur la frontière Irako-Syrienne :

I remember the scene well. It was the day that I arrived at the Iraqi-Syrian border crossing of Fishkhabour.

With shocked, sunburnt faces, men, women and children in dirt-caked clothes were struggling in temperatures of over 45 degrees Celsius (113 Fahrenheit), waiting patiently for local Kurdish aid.

At first, I focused my camera on a group of women sitting on the ground, but when I turned away I saw this little girl.

I took one shot of her there and as she saw me, she gave me a smile. I captured another frame of her with her mother.

I was drawn to her wild beauty in this terrible situation. There is a kind of intensity, distress and sadness in her eyes.

I know that she is 6 years old because I asked her mother, but unfortunately I didn’t ask for her name. The family was coming from the Iraqi town of Sinjar, fleeing Islamic State militants.

It was really sad not only to see this girl, but also to see the hundred others who were dirty, exhausted, and sitting amongst garbage in the heat.

I have been in Iraq for over a week now. It’s my first time in the country, and though I have been to many conflict zones, nothing compares to seeing these displaced people.

I wonder what their state of mind can be as they walk for miles and hours through the mountains with a few of their belongings.

I would be very curious to see the blonde girl who I photographed again. I wonder what will become of her. I wonder what will become of all the others.

#JeSuisCharlie #EtTaSoeurElleBatLePavé?

January 11th, 2015

Stupid…

Stupids…

Charlie after Delacroix

January 9th, 2015

Gary Barker (@Barkercartoons), Illustrator and political cartoonist for the Times, Guardian & Tribune

Plantu (@plantu), Illustrator for Le Monde and L’Express

Charlie

January 7th, 2015

 

 

Genealogy of the Black Swan Problem

January 2nd, 2015

Cocorico

January 1st, 2015

Deux textes optimistes pour bien commencer l’année :

Moon Over Nubble

December 30th, 2014

Great image by Michael Blanchette

Communication Patterns around the World

December 29th, 2014

Outils de gestion de sites

December 29th, 2014

7 outils gratuits et open source utiles au SEO

D’après un article du Journal du Net en collaboration avec Jean-Benoît Moingt.

  1. Serposcope est un outil de suivi de mots clés en PHP, à s’installer sur son ordinateur ou chez un hébergeur.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "Complet, Serposcope propose un gestionnaire de proxies et la résolution de captchas. Utile, car Google peut essayer de bloquer ce genre d’outils. Serposcope est également l’un des rares outils de suivi de positions à gérer le paramètre “uule” permettant de simuler des recherches géolocalisées.Toutes les données récupérées sont stockées dans une base MySQL, ce qui permet de la récupérer facilement."
  2. A la fois utile pour crawler et indexer, Mnogosearch est un logiciel venant de Russie et développé en C++.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "C’est surtout sa fonctionnalité de crawler qui va intéresser en SEO. Balises à récupérer, vitesse, maillage interne, respect ou non du robots.txt : un crawl Mnogosearch est 100% customisable. Contrairement à la plupart des crawlers SEO, Mnogosearch sait gérer de très grosses volumétries. Un site de 10 millions de pages ne lui fera pas peur ! Seul inconvénient, il ne faudra pas avoir peur de travailler en ligne de commande, car Mnogosearch ne propose pas d’interface graphique."
  3. Disponible depuis déjà 7 ans, SEO Soft est également un logiciel de suivi de positions de mots clés.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "Contrairement à Serposcope, il s’agit d’un logiciel du bureau, qui sera donc facilement installable par les plus néophytes. Très simple d’utilisation, SEO Soft est parfait pour suivre quotidiennement l’évolution de quelques dizaines de mots clés. SEO Soft ne permettant pas l’utilisation de proxies, il n’est cependant pas adapté à des interrogations massives."
  4. WatussiBox Free est un outil d’analyse du comportement du robot d’indexation Googlebot.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt (qui a développé l’outil) : "Cet outil permet de voir les fréquences de passage de Googlebot, les pages en erreurs, les pages nouvellement découvertes… WatussiBox Free peut directement se brancher à votre serveur Apache (sur un serveur dédié) ou fonctionner grâce à un tracker PHP (sur un hébergement mutualisé)."
  5. Disponible sur Github, SEOstats permet d’obtenir une grande partie des informations utiles au SEO.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "SEOstats est une librairie PHP incontournable pour ceux qui développent leurs propres outils SEO. SEOstats propose en effet de nombreuses fonctions qui permettent de gagner un temps précieux : récupération du PageRank d’une page, du nombre de pages indexées, résultats de SERPs… SEOstats permet également de récupérer des données d’Alexa, de SEMrush, de Mozscape… Un must !"
  6. La page officielle dédiée au projet Kibana annonce clairement son objectif : “donner du sens à une montagne de logs”.
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "Son utilisation dépasse très largement le petit monde du SEO, mais Kibana est un outil incroyable pour se créer des dashboards. Kibana récupère et croise tous les flux de données que vous lui donnerez à manger : visites, crawl, clics, ventes, géolocalisation… Kibana vous permet ensuite de créer vos KPIs et de choisir la visualisation la plus adaptée. Il ne vous reste plus qu’à afficher votre dashboard sur un écran et de suivre l’évolution en temps réel !"
  7. Piwik est un outil de Web Analytics, comme Google Analytics, mais open source (lire le zoom sur cet outil).
     
    Le commentaire de Jean-Benoît Moingt : "Outre les avantages en termes de vie privée (aucun tiers ne récupère vos données), le fait d’avoir une information stockée dans une base de données facilement interrogeable est un plus indéniable pour Piwik. Vous pouvez ainsi facilement créer des indicateurs du type ‘articles les plus lus aujourd’hui’, ’23 personnes regardent ce produit actuellement’… Piwik est sans doute le seul outil de web analyse à permettre une visualisation qui tient la route depuis un mobile, le dashboard étant en responsive design. Il faudra cependant avoir une grosse base de données à disposition, le volume de données stockées prenant rapidement beaucoup de place."

5 outils pour auditer un site web

D’après un autre article du Journal du Net.

  1. Xenu “Link Sleuth” est un logiciel (à installer sur PC) conçu pour réaliser le scan détaillé d’un site afin de détecter de manière assez exhaustive ses éventuels problèmes et surtout ses liens cassés. L’outil peut aussi analyser les liens JavaScript.
     
    Il va ensuite faire remonter des erreurs comme les 404, mais aussi les redirections 301 ou 302. Les problèmes de DNS, de contenu dupliqué ou de temps de chargement peuvent aussi apparaître, entre bien d’autres indicateurs à prendre en compte pour optimiser l’indexation d’un site. L’outil peut analyser des sites en local, ou ceux sécurisés via SSL. Cerise sur le gâteau : il est totalement gratuit.
  2. Autre outil gratuit d’audit SEO, également à installer sur un PC, LinkExaminer va parcourir une page donnée, et surtout ses liens afin de faire remonter leurs caractéristiques : liens pointant vers l’extérieur ou l’intérieur du site, nofollow, codes d’erreur associés (301, 404…), mais aussi temps d’accès, dates de modification, poids et profondeur des pages.
     
    Il est aussi possible de savoir si les URLs listées sont visées par le robot.txt, ou si les liens ou pages sont générés de manière dynamique. Une colonne baptisée SEO donne également quelques conseils (Title trop long, meta description manquante). Les exports en fichier .csv sont possibles, mais, comme pour Xenu, l’outil peut avoir du mal à parcourir des sites de grande dimension.
  3. Disponible pour Mac et PC, Screaming Frog va aussi analyser un site, ses liens, images, CSS et scripts pour en ressortir des indicateurs utiles à l’indexation et au SEO.
     
    Au-delà des erreurs HTTP de type 3xx, 4xx et 5xx, l’outil va également faire remonter les balises Title, H1 ou H2 manquantes, dupliquées ou trop longues. L’ancre des liens rencontrés est précisée, tout comme leur caractère dofollow ou non. Il est aussi possible de changer l’user agent afin de parcourir le site comme le feraient les robots de Google ou Bing.
     
    Le logiciel est disponible gratuitement, mais certaines options (nombre d’URLs analysées illimitées, crawls précédents sauvegardés, analyse plus fine de code source) nécessitent une licence payante.
  4. Dans sa suite SeeURank, le français Yooda propose de nombreuses fonctionnalités pour auditer un site : analyse des liens cassés, des balises HTML dupliquées, de l’éloignement par rapport à la page d’accueil, liste des ancres… SeeURank fait aussi ressortir les mots clés de la page et du site, et leur densité. La suite, payante, ne se limite cependant pas à l’analyse des critères on-page, mais propose d’analyser les backlinks ou de suivre les positions dans les moteurs.
     
    Yooda vient tout juste de lancer ses Webtools facturant à l’usage certaines fonctionnalités, comme la suggestion de mots clés et l’analyse de la visibilité de la concurrence.
  5. La suite Advanced Web Ranking, ou “AWR”, propose plusieurs fonctionnalités d’analyse des critères on-page utiles au SEO. Son module “Website Auditor” fait ainsi remonter les erreurs 3xx 4xx ou 5xx, les balises Title dupliquées, ou vides, mais aussi le nombre de liens internes et externes, nofollow ou non, ainsi que le nombre de fois que la page a été partagée sur Facebook, Twitter ou Google+. L’analyse de mots clés est aussi au rendez-vous.
     
    Toutes ces fonctionnalités sont présentes dans la version payante Entreprise de la suite, qui ne se limite pas à l’analyse des éléments sur site (Web Analytics, analyse de positions, des mots clés et des backlinks). La version standard, qui peut être gratuite, se limite à un audit SEO on page moins exhaustif.

How to argue with research you don’t like

December 24th, 2014

I Am a Maker

December 22nd, 2014

Breast Cancer Screening: Benefits and Harms

December 20th, 2014

A picture is worth a thousand words, and this illustration from the JAMA will unfortunately never be displayed on giants billboards as advertising in favor of breast cancer screening keeps on being.

When to Use JPEG, GIF and PNG

December 18th, 2014

From WhoIsHostingThis

All products are conversations

December 17th, 2014

People who work at Walmart talk about hating Walmart.

People who work at Starbucks talk about the day to day of customer service. Difficult customers, that kind of thing.

Big difference.

Nowadays, people talk a lot. On a multitude of channels. From blogs to big papers and everything in between.

Unless you have an army of publicists, you’re going to have trouble managing that conversation.

Much better to give them something great to talk about.

Control the conversation, by starting it in the right place.

Text and cartoon by @gapingvoidart

Les Mots en l’air

December 14th, 2014

Les mots qu’on lance vers les étoiles ne sont pas toujours des paroles en l’air. Jongler avec les mots n’est pas donné à tout le monde. Il faut faire preuve d’habileté, de souplesse, de virtuosité. Un mot qui tombe mal ou qui tombe à côté ou que vous recevez, comme ça, en pleine poitrine, alors que vous ne vous y attendiez pas, peut faire des dégâts, il peut être blessant. Et je ne vous dis rien des séquelles et des traumatismes pendant des mois, des années. Combien d’estropiés du cœur après des collisions verbales. Il ne faut jamais l’oublier : les mots sont dangereux. Ils doivent être maniés avec infiniment de précaution.

Les mots qu’on envoie en l’air ont besoin de souffle et d’inspiration. Il existe des mots lourds de sens, mais qui surtout pèsent des tonnes. Tournez les pages de votre quotidien, faites défiler les actualités sur votre tablette. C’est fou comme les journaux sont remplis de déclarations, de proclamations, de promesses, de décrets, de divulgations, de révélations…

Mais les mots en l’air quand ils sont vifs comme des cabris, vaporeux comme des elfes, légers comme de la chantilly, sont des bouffées de fraîcheur qui longtemps voltigent comme des feuilles d’automne sous le préau de notre conscience.

« Je fais souvent ce rêve étrange et pénétrant. Ne me secouez pas. Je suis plein de larmes. Dans l’eau de la claire fontaine elle se baignait toute nue. Y’a d’la joie ! J’en ai tant vu qui s’en allèrent ils ne demandaient que du feu. Je chante un baiser »…

Dans quelques années, dans quelques mois, dans quelques jours, enfin, tout de suite, là, dans quelques instants, nous aurons oublié les mots qui aujourd’hui font les importants, qui se poussent du col, qui jouent les gros bras et longtemps nous seront reconnaissants à Paul Verlaine, à Henri Calet, à Georges Brassens, à Charles Trenet, à Louis Aragon, à Alain Souchon, à tant d’autres, d’être de si fidèles compagnons qui ont su suspendre en apesanteur les mots de la mémoire et de la consolation.

François Morel

The Collaboration Pyramid revisited

December 8th, 2014

In a great blog post, Oscar Berg (@oscarberg) revisited the collaboration pyramid by showing the social immersed part of the iceberg that allows collaboration processes to come true.

Oscar Berg’s greatly valuable contribution is to state that all these "under the water" processes can remain implicit when a team meets in real life, but, as deep foundations, must be explicitly addressed when social activities are operated through electronic media.

Complexity Rising: From Human Beings to Human Civilization

November 24th, 2014

Could you believe that this plainly modern picture illustrates a paper by Yaneer Bar-Yam published in 1997?


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